1、装置

在运用生物显微镜时，首先要根据运用要求，选用恰当的扩大倍数。生物显微镜的总扩大倍数为：物镜扩大倍数乘上目镜扩大倍数。

将生物显微镜各扩大倍率的物镜按次序装在转换器上，在物镜装置前必定要将物镜的螺纹相触摸端面以及转换器的螺孔进行清洁处理，不允许有任何灰尘存在，不然，会形成装置不良而影响光学系统和成像质量。接着将目镜插入目镜筒中，等待调查运用。

将所要调查的标本切片放置在工作台面上并用压片夹把标本切片压齐，如有移动尺的生物显微镜可用袄脚将标本切片卡平稳，不然当移动尺作纵向或横向移动时，调查的像质不稳定，当然这也可能是由于移动尺本身质量欠好所造成的。如有像质不稳定时，则可作适量的微调即能弥补这个缺陷。

2、照明

在运用生物显微镜调查标本切片时，需求有必定的照明，其照明的光源有自然光源和人工光源两种，不管用哪种光源，为使在调查时能得到明晰的物象，其亮度有必要适中。要得到适中的亮度，能够从几个方面进行调理：一方面能够选用平面的或凹面的反光镜，一起又能够滚动反光镜的位置而得到不同的亮度。

当光线比较暗时，可选用凹面反光镜以使光线进行会聚而提高亮度。当光线比较强时，则选用平面反光镜，这时反光镜使光线转向效果降低亮度。注意切勿将太阳光直射反光镜，以免使人感觉目眩，然后影响调查。如有聚光镜的生物显微镜则可将聚光镜作上下移动使其亮度适中，别的也能够改变可变光阑的孔径以达到适中的亮度。假如光线太暗时，则可将聚光镜恰当上升，使可变光阑的孔径恰当扩大。假如光线太强时，则可将聚光镜恰当下降，使可变光阑的孔径恰当减小。

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