数码显微镜的主机架上开有多处照明光源灯壳、照像装配、记录装配、电视发生器和光电元件的持续口。在这些持续口与成像光路系统之间不可能同时接通光路。照明光源发出的光束首先供应某一成像系统。例如供应落射光成像系统或供应透射光成像系统。也可供应可见光系统或供应紫外光系统。经由观察校准物像之后，偶而需要转向装有黑白底片的照像暗盒，同时又转向装有彩色底片的照像暗盒。偶而也想显微拍照的同时举办光密度扫描量。凭据这样复杂的需要，现在数码显微镜都有种种类型的光路转换装配。

数码显微镜的光路转换装配可分为两大类：

一种是数码显微镜主机架内部装配的光路转换机构。

正置数码显微镜主机架内下部有一反射镜，从数码显微镜基座外部侧面的拉杆可拉出光路或推进光路。以这种方式将光源可用于透射光观察，也可转换光路用于落射光观察。这个数码显微镜主机架内物镜转换器上方也有一反射镜。也用拉杆抽出或推进。用此反射镜将光束用于观察或用于显微照像。照像暗盒能够装进主机架内部，它的双筒歪斜式镜筒下方持续着一张反射镜。镜简向前面歪斜时光源供观察，而将镜筒向后旋转180°角时反射镜转向照像暗盒光束，用于照像。

倒置数码显微镜的主机架反面有可见光光源灯壳持续口和紫外光光源灯壳持续口。其主机架可用于透射光观察，也可用于落射光观察。所以在主机架内部后方有光路转换装配，将两种光源和两种用途之间举办光路转换。

另一大类就是现代大型数码显微镜的镜简头内的光路转换装配。

这种镜筒头向下边持续物镜转换器，向前面持续镜简，向上方持续种种接收器、记录器等。用它右侧的小拉杆拉出1-3档，也可旋转拉杆举办各向光路转换。

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